列入CITES(华盛顿公约)濒危等级: 附录Ⅰ生效年代: 1997
列入中国国家重点保护动物等级: 一级 生效年代: 1989
列入中国濒危动物红皮书等级: 濒危 生效年代: 1996
列入《世界自然保护联盟》(IUCN) 2013年濒危物种红色名录ver 3.1——极危(CR)。
在1980年,我国林业部门将海南斧头岭林区划作保护区,并开展了一系列的保护研究工作,使得海南黑冠长臂猿得以在这最后的一小片家园里休养生息。到了90年代初,虽然海南省全面停止了对天然林的砍伐,但除了霸王岭自然保护区还有不到7只海南黑冠长臂猿之外,其它地区的海南黑冠长臂猿由于得不到有效保护和种群数量过少,就都逐渐没有了踪迹。在随后的几年中,保护区的工作人员数次观察到雌猿怀孕和雌猿怀抱刚出生猿崽,由此累加,到2003年2月,应为4群24只。2000年活动于斧头岭下的B群共7只,其中两只成年母猿,一只老公猿,两只黑色公猿(其中一只可能是未成年的母猿)和两只小猿。到2001年这一群只剩下4只,两母一公和一小崽。减少的原因可能是分群;也可能是自然死亡,也可能是被猎人射杀了。
经过20多年的艰苦保护,海南黑冠长臂猿才又呈现恢复增长趋势。至2008年,海南黑冠长臂猿仅存于海南省霸王岭自然保护区这片面积只有2000公顷的热带山地雨林“孤岛”里,共四群18只,其中母猿6只,公猿和仔猿12只。